عنوان اختراع: كیت تشخیص RNA ویروس هاری(Rabies virus)توسط تكنیك تك دمایی RT-LAMP در سویه های در گردش در ایران

خلاصه اختراع

اختراع حاضر باعنوان " طراحی 6 پرایمر جهت تشخیص RNA ویروس هاری(Rabies virus)توسط تكنیك تك دمایی RT-LAMP در سویه های در گردش در ایران " ، شامل 6 پرایمر می باشد كه در جهت تشخیص RNA ویروس هاری طی تكنیك تك دمایی RT-LAMP به كار می رود. در مطالعه ای كه در ژاپن برای تشخیص ویروس هاری از طریق این تكنیك صورت گرفت پرایمر هایی طراحی شدند كه در عمل قادر به اتصال به توالی هدف خود نبودند به همین دلیل طی استفاده از آن ها نتیجه مطلوبی حاصل نشد و برآن شدیم تا پرایمر های كارآمدی را طراحی نماییم. طراحی پرایمر ها از طریق نرم افزار LAMP Primer designing soft ware primer explorer V3 بر اساس توالی نوكلئوتیدی ویروس هاری با شماره توالی NC_001542.1 در سایت NCBI انجام گرفت. برای طراحی پرایمرهای LAMP باید وارد سایت Eiken شده و به صورت برخط، طراحی پرایمر انجام می گیرد. در این پروژه، از نسخه V5 برای طراحی پرایمر استفاده گردید. در آغاز طراحی پرایمرها، نرم افزار به صورت اتوماتیك درصد GC را محاسبه می كند و همان طور كه اشاره شد سكانس هدف باید بین 2000-500 جفت باز باشد و دقت شود كه از این حدود خارج نشود. در نهایت 6 پرایمر شامل 2 پرایمر خارجی، 2 پرایمر لوپ و 2 پرایمر داخلی براساس ژن N طراحی شدند كه قادر بودند با اختصاصیت بالایی به توالی هدف خود متصل شوند.